水作為生命之源、生產之要、生態之基與每個人的生命和生活息息相關，它不僅直接影響到人們的日常生活生產，而且影響到經濟社會發展，甚至影響到社會的和諧穩定。雖近年來，各個機構不斷加大了對水源地的保護，但是這是遠遠不夠的，因為與地下水相比，水源地水庫的水體生物組成更為復雜，生物的影響作用更加明顯。浮游生物在水庫水體生態系統中占據重要地位，是運用生物調控手段防止水質富營養化的重點控制對象，在水源地保護中具有重要的指示性作用。因此浮游植物鑒定的種類與數量，作為水質檢測項目的補充和完善。通過增加水源地水庫浮游植物的鑒定，使水質檢測內容更加廣泛、更加科學。
1.浮游植物種群數量與水體營養鹽含量密切相關
　　某些種類的浮游植物特別喜歡生活在營養豐富的肥沃水體中，一旦發現其大量繁殖而形成優勢種群時即可認定該水體營養鹽異常豐富，必須引起人們的警惕，從而促使人們認真探查水源地的污染來源，為快速查找污染源提供參考。
2.浮游植物監測有利于預測“水華”暴發
　　當某些種類的浮游植物成為水體中的優勢種群大量存在時，人們必須警惕水體發生“水華”的危險，如藍藻門的銅綠藻、微囊藻、水華微囊藻、假絲微囊藻、水華魚腥藻，裸藻門中的血紅裸藻等是形成“水華”的常見種類。這些種類的浮游植物通常被視為“水華”指標性物種，從而為人們提前預判、進而采取相應措施提供參考，盡量避免發生嚴重水污染事件。
3.浮游植物在食物鏈中具有重要作用
　　水體中浮游植物位于植物鏈中的較低端，是水體中的初級生產者，在食物鏈中發揮著較重要的作用。通過對其種群與數量的監測可以指導人們運用生物調控手段綜合利用浮游植物，保持水體生態平衡。例如可以根據水體中浮游植物數量的多少和種類構成來調整濾食性和其他種類經濟魚類放養密度與比例，從而合理利用和控制水體中浮游植物數量，以達到維持水體生物平衡的目的，增強水體的自我調節能力，避免水質發生劇變。
       以上就是浮游植物鑒定的重要性。水資源的保護及水污染的防治包含了很多方面，在浮游植物鑒定方面也是不容忽視的。